Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gga3Q8BMI3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms