Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms