Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc172Q810N9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms