Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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