Protein–RNA interactions for Protein: Q80YA8

Crb2, Protein crumbs homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb2Q80YA8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Crb2Q80YA8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crb2Q80YA8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crb2Q80YA8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crb2Q80YA8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crb2Q80YA8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crb2Q80YA8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crb2Q80YA8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Crb2Q80YA8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms