Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpp38Q80UU2 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Rpp38Q80UU2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Rpp38Q80UU2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpp38Q80UU2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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