Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SynmQ70IV5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SynmQ70IV5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms