Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Topbp1Q6ZQF0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms