Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Herc4Q6PAV2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Herc4Q6PAV2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms