Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NipblQ6KCD5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NipblQ6KCD5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms