Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Swap70Q6A028 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms