Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Pdzrn3Q69ZS0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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