Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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ScxQ64124 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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ScxQ64124 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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ScxQ64124 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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ScxQ64124 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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ScxQ64124 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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ScxQ64124 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
ScxQ64124 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms