Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Polr2kQ63871 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms