Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AtmQ62388 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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AtmQ62388 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AtmQ62388 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
AtmQ62388 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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