Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Six2Q62232 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six2Q62232 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six2Q62232 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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