Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sycp1Q62209 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sycp1Q62209 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms