Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssr4Q62186 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ssr4Q62186 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssr4Q62186 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ssr4Q62186 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssr4Q62186 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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