Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sin3bQ62141 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms