Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PrkciQ62074 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms