Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SkiQ60698 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SkiQ60698 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms