Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CttnQ60598 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms