Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

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Length 820 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scarf1Q5ND28 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scarf1Q5ND28 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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