Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf3Q5HZG4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf3Q5HZG4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf3Q5HZG4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf3Q5HZG4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf3Q5HZG4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Taf3Q5HZG4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Taf3Q5HZG4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms