Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lrrc47Q505F5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lrrc47Q505F5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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