Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp30Q3UN04 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms