Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc34Q3UI66 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms