Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nkx6-3Q3UHX8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nkx6-3Q3UHX8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nkx6-3Q3UHX8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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