Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trafd1Q3UDK1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trafd1Q3UDK1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms