Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44742-201ENSMUST00000207190 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Prdm6-202ENSMUST00000115398 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms