Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Srsf6Q3TWW8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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