Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWI9

Tmem63b, CSC1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem63bQ3TWI9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmem63bQ3TWI9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmem63bQ3TWI9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms