Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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1700066B19RikQ3TS39 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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1700066B19RikQ3TS39 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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1700066B19RikQ3TS39 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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1700066B19RikQ3TS39 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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1700066B19RikQ3TS39 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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1700066B19RikQ3TS39 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
1700066B19RikQ3TS39 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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1700066B19RikQ3TS39 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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1700066B19RikQ3TS39 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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