Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc102aQ3TMW1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms