Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rpusd3Q14AI6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rpusd3Q14AI6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rpusd3Q14AI6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rpusd3Q14AI6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rpusd3Q14AI6 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Rpusd3Q14AI6 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rpusd3Q14AI6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rpusd3Q14AI6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms