Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb8Q0VBD0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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