Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc3h18Q0P678 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms