Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Neurl1bQ0MW30 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Neurl1bQ0MW30 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms