Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrioQ0KL02 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms