Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MestQ07646 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MestQ07646 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MestQ07646 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MestQ07646 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms