Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gdf9Q07105 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gdf9Q07105 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms