Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Siah1bQ06985 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms