Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mex3cQ05A36 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mex3cQ05A36 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms