Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd1Q04519 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms