Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdcd1Q02242 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdcd1Q02242 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdcd1Q02242 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdcd1Q02242 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdcd1Q02242 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pdcd1Q02242 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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