Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RykQ01887 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RykQ01887 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RykQ01887 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RykQ01887 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RykQ01887 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RykQ01887 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RykQ01887 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RykQ01887 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RykQ01887 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
RykQ01887 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RykQ01887 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RykQ01887 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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RykQ01887 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RykQ01887 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RykQ01887 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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