Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd1Q01822 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms