Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Grin2bQ01097 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grin2bQ01097 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms