Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Pitx2P97474 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms