Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cmklr1P97468 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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